Kruhoústí, ryby, obojživelníci, plazi a savci.
Ve 2. dílu Červené knihy je zahrnuto celkem 114 druhů z řad kruhoústých, ryb, obojživelníků, plazů a savců. Podle stupně ohrožení jsou uvedené druhy a poddruhy zařazeny do šesti kategorií: vymizelé, kriticky ohrožené, ohrožené, vzácné, zachráněné a vyžadující další pozornost. Statě věnované jednotlivým druhům jsou psány s ohledem na poslání publikace. Stejně jako v 1. dílu zde proto nenajdeme popisy živočichů, ale pouze údaje důležité z hlediska ochrany. Členění těchto údajů je jednotné. Po vědeckém, českém a slovenském názvu následuje status, rozšíření a početnost, popis stanoviště, biologie, hodnota druhu a ochrana.